微生物實驗室常用的器材一般包括玻璃器材、金屬器械、橡膠制品及塑料制品等，每類器材的處理及消毒措施都有不同。嚴格的消毒滅菌工作極為重要，直接影響著整個實驗能否順利進行。
消毒滅菌方法
      目前，常用的消毒滅菌方法多采用物理方法和化學方法兩大類。
      1.干熱滅菌法是利用恒溫干燥箱內120℃-150℃的高熱，并保持90-120分鐘，殺死細菌和芽孢，達到滅菌目的的一種方法。
      主要適用于不便在壓力蒸汽滅菌器中進行滅菌，且不易被高溫損壞的玻璃器皿、金屬器械以及不能和蒸汽接觸的物品的滅菌。用此方法滅菌的物品干燥，易于貯存。酒精燈火焰燒灼滅菌法也是屬于干熱滅菌的方法之一，在進行動物細胞體外培養工作時，常須利用工作臺面上的酒精燈火焰對金屬器具及玻璃器皿口緣進行補充滅菌。 
      2.濕熱滅菌法壓力蒸汽濕熱滅菌法是目前最常用的一種滅菌方法。
      它利用高壓蒸汽以及在蒸汽環境中存在的潛熱作用和良好的穿透力，使菌體蛋白質凝固變性而使微生物死亡。適合于布類工作衣、各種器皿、金屬器械、膠塞、蒸餾水、棉塞、紙和某些培養液的滅菌。
      3.射線滅菌法利用紫外線燈進行照射滅菌的方法。
       紫外線是一種低能量的電磁輻射，可以殺滅多種微生物。紫外線的作用機制是通過對微生物的核酸及蛋白質等的破壞作用而使其滅活。適合于實驗室空氣、地面、操作臺面滅菌。
       4.過濾除菌法是將液體或氣體通過有微孔的濾膜過濾，使大于濾膜孔徑的細菌等微生物顆粒阻留，從而達到除菌的方法。過濾除菌法大多用于遇熱易發生分解、變性而失效的試劑、酶液、血清、培養液等。目前，常用微孔濾膜金屬濾器或塑料濾器正壓過濾除菌，或用玻璃細菌濾器、濾球負壓過濾除菌。
       5.化學消毒劑消毒法用于那些不能利用物理方法進行滅菌的物品、空氣、工作面、操作者皮膚、某些實驗器皿等。在使用時應注意安全，特別是用在皮膚或實驗材料上的消毒劑，須選用合適的藥劑種類、濃度和處理時間，才能達到安全和滅菌的目的。 
      6.抗生素抑菌法主要用于培養液，是培養過程中預防微生物污染的重要手段以及作為微生物污染不嚴重時的“急救”措施。常用的抗生素有青霉素、鏈霉素和新霉素等。

不同種類物品及培養物的消毒滅菌方法
       1.無菌操作室滅菌
       培養材料進行培養、觀察或更換培養液時，必須從各方面防止任何污染物進入培養液或容器，所以無菌操作室的滅菌是至關重要的。經常使用的無菌操作室，在每次使用前都應進行地面衛生清潔，并用紫外線燈照射30min，進行空氣滅菌。對超凈工作臺，每次操作前用紫外燈照射30min，然后用70%-75%酒精擦拭。
      2.培養液滅菌
      培養液在制備過程中帶有各種雜菌，分裝后應立即滅菌，或在24小時內完成滅菌工序?；驅ε囵B液中耐熱組分先進行高壓蒸汽滅菌，然后在無菌室加入經過過濾除菌的不耐熱溶液，混勻后分裝備用。

      3.玻璃器皿、塑料器皿和器械滅菌
      玻璃器皿可進行干熱滅菌或高壓蒸汽滅菌，但在蒸汽滅菌后最好及時烘干水分。對不能進行高壓蒸汽滅菌的塑料器皿可用75%酒精浸泡，使用前在無菌操作臺面上晾干的同時，用紫外線重復殺菌。實驗室還可以用環氧乙烷滅菌袋對塑料器皿進行消毒，消毒后的器皿要充分散氣2-4小時后才可使用。無菌操作所用的各種器械，一般采用干熱或高壓蒸汽滅菌，或用75%酒精浸泡，然后在無菌操作臺面上晾干的同時再用紫外線重復殺菌;在使用期間可多次對其進行酒精燈火焰灼燒滅菌。

      4.培養材料的消毒滅菌
     采自動物機體的實驗材料，攜帶著微生物及雜質，接種前須進行表面消毒滅菌，對內部已受微生物侵染的材料應予以淘汰。從動物機體采集的某些組織塊，須用消毒劑進行浸泡處理，進行表面消毒。常用消毒劑有過氧化氫(10~12%，浸泡5~15 min)、過氧乙酸(0.05%，浸泡30s~1min)、酒精(70~75%，浸泡2 min)。

滅菌程序驗證內容
     1、撰寫驗證方案及制定評估標準。
     2、確認滅菌設備技術資料齊全、安裝正確，并能處于正常運行。
    3、確認關鍵設備控制儀表在規定的參數范圍內能正常運行。
    4、采用被滅菌物品或模擬物品進行重復實驗確認滅菌效果符合規定。
    5、完善文件記錄，撰寫驗證報告。

滅菌程序運行監控
    1、關鍵參數應在驗證確定的范圍內：溫度、壓力、時間、濕度、滅菌氣體濃度、輻照劑量等。
    2、滅菌程序定期驗證，時效不超過半年。3、滅菌設備或程序發生變更重新進行驗證。
滅菌保證
    1、滅菌效果與滅菌前產品污染程度及污染菌特性有關，把握微生物污染水平及污染菌耐受性，注意各個環節降低污染程度。
    2、滅菌冷卻階段防止已滅菌物品再次污染。
   3、適用生物指示劑、化學指示劑等監控滅菌結果
 生物指示劑的基本要求：
    1、菌種的耐受性應大于需滅菌產品中所有可能污染菌的耐受性。
    2、菌種應無致病性。
    3、菌株應穩定，存活期長，易于保存。
    4、易于培養。若使用休眠孢子，孢子含量在90%以上。